Damit ein sicherer Schiffsverkehr gewährleistet werden konnte, mussten sofort alle noch fahrenden Tonnenleger in Betrieb genommen werden. In den letzten Kriegsmonaten wurden Seeminen ausgelegt und eine Passage der Seewege war sehr gefährlich. Doch die Royal Navy gab am 20. September den Befehl: „kein Handelsschiff darf von irgendeinem deutschen Hafen auslaufen, es sei denn mit Erlaubnis oder auf Befehl der Alliierten Vertreter“. Aber schnell wurde klar, die Tonnenleger müssen wieder fahren. Die beiden letzten Tonnenleger WILHELMS und BUSSARD bekamen sofort eine Fahrerlaubnis und alle benötigten Materialen an Bord.
Auch an Land gab es schwere Schäden. Der alte Tonnenhof war weitgehend zerstört. Ein provisorischer Tonnenhof wurde unmittelbar in der Nachbarschaft auf dem Gelände der Luftwaffe eingerichtet.